neuroConstruct sedang dikembangkan di Silver Lab di Departemen Ilmu Saraf, Fisiologi dan Farmakologi di UCL. neuroConstruct telah dirancang untuk menyederhanakan pengembangan jaringan kompleks neuron realistis biologis, yaitu model yang menggabungkan morfologi dendritik dan konduksi membran sel yang realistis. Ini diimplementasikan di Java dan menghasilkan file skrip untuk simulator NEURON dan GENESIS, dengan dukungan untuk platform simulasi lainnya (termasuk PSICS, MOOSE dan PyNN) dalam tahap pengembangan lanjutan. Ini menggunakan spesifikasi NeuroML terbaru, termasuk MorphML, ChannelML dan NetworkML. Pengembangan perangkat lunak ini dimungkinkan dengan pendanaan dari Wellcome Trust, Medical Research Council dan EU Synapse Project. Beberapa fitur utama neuroConstruct adalah: * neuroConstruct dapat mengimpor file morfologi dalam format GENESIS, NEURON, Neurolucida, SWC dan MorphML untuk dimasukkan dalam sel tunggal atau model jaringan, atau sel yang lebih abstrak juga dapat dibangun secara manual. * Pembuatan jaringan neuron berbasis konduksi diposisikan dalam 3D * Pola konektivitas kompleks antara grup sel dapat ditentukan untuk jaringan * Skrip simulasi dapat dihasilkan untuk simulator berbasis NEURON, GENESIS, MOOSE, PSICS dan PyNN (catatan: tidak setiap proyek dapat dihasilkan untuk setiap simulator) * Mekanisme seluler realistis biofisik (mekanisme sinapsis / saluran) dapat diimpor dari file skrip asli (*.mod atau *.g) atau dibuat dari template menggunakan ChannelML * Pembuatan kode otomatis untuk merekam data simulasi dan visualisasi / analisis data dalam neuroConstruct * Simulasi yang direkam dapat dilihat dan dikelola melalui antarmuka Simulation Browser * Antarmuka skrip berbasis Python dapat digunakan untuk mengontrol pembuatan model dan eksekusi, memungkinkan beberapa simulasi dijalankan untuk pengoptimalan model sel dan jaringan
Riwayat versi
- Versi 1.6.0 diposting di 2012-08-23
Detil Program
- Kategori: Pendidikan > Ilmu
- Penerbit: University College London
- Lisensi: Gratis
- Harga: N/A
- Versi: 1.6.0
- Platform: windows